В год в Зауралье появляется более шестисот тысяч тонн отходов. Некоторая доля, в частности, отходы деятельности щебеночного карьера, используется для рекультивации, часть - например, пластик и ртутные лампы - перерабатывается специализированными предприятиями. Проблемой остается организация сбора бытового мусора и лицензирование полигонов в районах. Есть положительные примеры в Частоозерье, Альменеве и Каргаполье, но в ряде районов утилизация как следует не организована.
Тревогу экологов вызывают бесхозные склады пестицидов по всей области. Тара разрушается, вредные химические вещества попадают в почву и воду. Ликвидировать пестициды самостоятельно региону не под силу, федеральная власть проблему не решает. Возможно, могла бы помочь законодательная инициатива зауральских депутатов в Госдуме.